Na metade do primeiro semestre de 2011, Sheik havia se desligado do Fluminense e assinou contrato no meio do mês de maio. Sem estar em atividade no clube carioca, treinou por duas semanas para recuperar a forma física, e no início de junho ficou pronto para entrar em campo.
Emerson Sheik, então, foi relacionado pelo técnico Tite para a partida do Timão contra o Flamengo, válida pelo Campeonato Brasileiro daquele ano. No segundo tempo, Emerson entrou em campo substituindo Jorge Henrique.
Sheik teve três passagens pelo Timão. Na primeira delas, a mais marcante, foi um dos principais nomes da conquista do título da Libertadores em 2012, marcando três gols em quatro jogos, um contra o Santos na semifinal, além dos dois na decisão.
Na segunda passagem, Sheik voltou ao time em 2015, mas sem espaço, acabou sendo negociado com o futebol carioca. Voltaria em 2018, aos 39 anos, e seria parte da equipe que conquistaria o Campeonato Paulista daquele ano. Aposentou-se do futebol profissional com 196 jogos e 28 gols com a camisa do Corinthians.
A estreia do nosso ídolo e herói Emerson Sheik completa 1⃣1⃣ anos! 👨🏽🦲🖤
📸 Daniel Augusto Jr / Agência Corinthians #VaiCorinthians pic.twitter.com/shufDUnqKG
— Corinthians (@Corinthians) June 5, 2022