Guilherme Nunes, recentemente, esteve emprestado à Ferroviária para a disputa do Campeonato Paulista. Após o fim do estadual, o volante retornou ao Santos e vinha treinando separado, no grupos de atletas não aproveitados por Fabián Bustos.
Em sete jogos pelo time de Araraquara no Paulistão, o jogador marcou um gol, diante do RB Bragantino. A partida foi válida pela quarta rodada do estadual.
Guilherme Nunes tem contrato com o Santos até o dia primeiro de maio de 2023. Formando nas categorias de base do Peixe, o volante também soma passagens por Paraná, Portuguesa e Náutico.