O jogador iniciou sua carreira no Grêmio Prudente, em 2011, e foi contratado pelo Maldonado, do Uruguai. Na nova equipe, Willian José foi emprestado para times do Brasil, como São Paulo, Grêmio e Santos. O atleta também chegou a integrar o Real Madrid Castilla.
📣 OFICIAL | El #RealBetis incorpora a Willian José 🆕💚
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— Real Betis Balompié 🌴💚 (@RealBetis) August 26, 2021
Em 2016, foi contratado em definitivo pela Real Sociedad, clube em que atuou por quatro temporadas e meia. No início de 2021, foi emprestado ao Wolverhampton, da Inglaterra, e não fez uma grande passagem. Pelos Wolves, o brasileiro atuou em 18 jogos, marcou um gol e deu uma assistência.
Willian José aguarda o momento de sua estreia representando seu novo clube. Neste sábado, o Betis recebe o Real Madrid, pela terceira rodada do Campeonato Espanhol, às 17 horas (de Brasília).