Rafael tem uma trajetória vitoriosa pelos dois clubes mais populares de Minas Gerais. Nascido na cidade mineira de Coronel Fabriciano, o goleiro começou a sua carreira no futebol no Cruzeiro.
No período em que esteve nas categorias de base da Raposa, foi campeão da Copinha e do Campeonato Brasileiro sub-20 em 2007, e acumulou convocações para defender a Seleção Brasileira, onde conquistou Campeonato Sul-Americano sub-20, na Venezuela, e disputou a Copa do Mundo sub-20, no Egito, em 2009.
Após ser promovido ao elenco principal do Cruzeiro, Rafael faturou o Campeonato Mineiro (2008, 2009, 2011, 2014, 2018 e 2019), o Campeonato Brasileiro (2013 e 2014) e a Copa do Brasil (2017 e 2018).
😀 Rafael: “Chegar ao São Paulo é a missão da minha vida”.#VamosSãoPaulo 🇾🇪
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— São Paulo FC (@SaoPauloFC) December 8, 2022
Em 2020, com mais de 100 jogos pelo Cruzeiro, o arqueiro deixou o clube e foi para o rival Atlético-MG. No Galo, Rafael também conquistou troféus importantes nas últimas temporadas: Campeonato Brasileiro (2021), Copa do Brasil (2021), Supercopa do Brasil (2022) e Campeonato Mineiro (2020, 2021 e 2022).