Em junho de 2019, Copete foi emprestado para o time mexicano com contrato válido por um ano. Apesar do bom início no clube, o atacante perdeu espaço até não fazer mais parte dos planos. O Pachuca abriu mão do jogador e aceitou abreviar o seu período na equipe.
¡Viernes de buenas noticias! A toda la comunidad Oro y Cielo, informamos que hemos llegado a un acuerdo con @Tuzos y @SantosFC para la llegada del delantero colombiano Jonathan Copete. El jugador formalizará su vínculo en las próximas horas ⚽👏#VamosEverton💙💛💙 pic.twitter.com/wmbjhuNVaC
— Everton de Viña (@evertonsadp) February 7, 2020
Jonathan Copete foi contratado pelo Santos em 2016 com vínculo válido até junho de 2021. O colombiano alternou bons e maus momentos após ser destaque no Atlético Nacional (COL).
No total, foram 135 jogos e 26 gols marcados pelo Peixe. Dessa forma, o atleta se consolidou como o maior artilheiro estrangeiro da história do clube. Apesar disso, perdeu espaço depois da chegada de Jorge Sampaoli e de outros estrangeiros no setor de ataque, como Cueva, Soteldo e Uribe, e acabou emprestado.
