O Primeiro-Ministro Shinzo Abe declarou estado de emergência na cidade sede dos Jogos e em outras seis províncias. Está proibida a entrada de qualquer pessoa que tenha viajado por países europeus nos últimos 14 dias. Mais de seis mil pessoas foram infectadas com a covid-19 no país.
A pandemia do coronavírus também foi o motivo do adiamento das Olimpíadas de Tóquio para 2021, depois de muitos pedidos vindos tanto de delegações quanto atletas.